Дисбактериоз (от греч. — «дис- - приставка, означающая "затруднение", "отклонение от нормы", "нарушение функции"» и «бактерия») — качественное изменение нормального видового состава бактерий (микрофлоры) в норме заселяющей полые органы, сообщающиеся с окружающей средой (например, верхние дыхательные пути, кишечник), и кожу человека.

С жизнедеятельностью микрофлоры связаны физиологический статус организма и состояние его неспецифических защитных сил. Представители так называемой нормальной микрофлоры, обычно обитающие в кишечнике, верхних дыхательных путях и на коже человека, благодаря выраженной антагонистической активности предохраняют эти органы от проникновения и быстрого размножения патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, выполняют ряд других функций.

Дисбактериоз возникает в результате нарушения равновесия кишечной микрофлоры из-за различных причин: применения антибактериальных веществ, в частности, антибиотиков, неправильного питания, нарушения функции иммунитета и т. п. В результате нарушения конкурентных взаимоотношений нормальной микрофлоры органа их место зачастую занимают патогенные микроорганизмы, например, грибы кандида или аспергилл.

Дисбактериоз был введен в научную литературу в 1916 году немецким врачом А.Ниссле. Современное питание включает много жирной пищи, копчености, консерванты, алкоголь, сахар и рафинированные напитки. При дисбактериозе кишечник не может усваивать такую пищу, т.е. расщеплять жиры, белки, углеводы. Не переваренные продукты гниют в организме и образуются токсины и яды, которые всасываются через стенки кишечника и далее по системе кровообращения по всему организму к различным тканям и органам, отравляют их и вызывают болезни.

Постепенно наступает хроническая интоксикация всего организма от отравления пищевыми ядами и продуктами гниения, нарушается обмен веществ, развиваются воспалительные заболевания многих органов и систем, появляется экзема, бронхиальная астма, рак толстой кишки и другие болезни.

Дисбактериоз является причиной девяти из каждых десяти тяжелых заболеваний организма и считается основной социальной болезнью 21-го века, дисбактериозом болеют 90% взрослого населения и свыше 25% детей в возрасте до года.